Résumé - Introduction à distance généralisée dans les génomes des graminées

Introduction à distance généralisée dans les génomes des graminées

2025-07-10 13:37:42

{"Yujie Huang","Shiyu Zhang","Hanyang Lin","Chenxu Liu","Zhefu Li","Kun Yang","Yutong Liu","Linfeng Jin","Chuanlong Lu","Yuan Cheng","Chaoyi Hu","Huifang Zhao","Guoping Zhang","Qian Qian","Longjiang Fan","Dongya Wu"}

{q-bio.PE,q-bio.GN}

Cette étude investigate le phénomène d'introgression à distance (RI), où du matériel génétique est transféré entre des espèces phylogénétiquement éloignées. Les chercheurs ont développé une méthode novatrice appelée RIFinder pour détecter des événements d'introgression et l'ont appliquée à un ensemble de données composé de 122 génomes de graminées. Ils ont identifié 622 événements d'introgression impliquant 543 gènes homologues, révélant des caractéristiques distinctes entre les sous-familles de graminées. La sous-famille Pooideae présentait le plus grand nombre de gènes introgressés, tandis que la sous-famille Bambusoideae en avait le moins. L'étude a également montré que les gènes introgressés sous-govent à une adaptation localisée, avec une enrichment fonctionnelle significative dans les voies de réponse aux stress. De plus, les chercheurs ont identifié un segment dérivé de la famille Triticeae dans une espèce de la famille Chloridoideae, potentiellement associé à sa tolérance exceptionnelle à la sécheresse. Ils ont également fourni des preuves que l'introgression a contribué à l'origine et à la diversification des gènes biosynthétiques de gramine, une alkaloid defensive chimique, chez les espèces de graminées. Dans l'ensemble, l'étude établit une méthode robuste pour la détection de l'introgression et met en lumière son rôle crucial dans l'évolution adaptative.